Գիշերային աշխատանքի ամենահաճախ հանդիպող «բարդությունը» ճարպակալումն է, որի հետևանքով նվազում է ինսուլինի մակարդակը, դանդաղում նյութափոխանակությունը, հորմոնալ անհավասարակշռություն է առաջանում, խախտվում է ածխաջրերի շրջանառությունը, ինչպես նաև արտաքին տեսքը զգալիորեն դեպի վատն է փոխվում։
Բացի այդ, քնի խախտման կամ անքնության, ինչպես նաև կենսառիթմերի խախտման հետևանքով բարձրանում է աթերոսկլերոզի, հիպերտոնիայի և սրտանոթային այլ հիվանդությունների առաջացման հավանականությունը։
Կարող է նաև թուլանալ իմունիտետը, հորմոնալ խախտում ևս կարող է առաջանալ, որի հետևանքով նույնիսկ անպտղություն է սպառնում։
Կարող եք բախվել նաև այնպիսի խնդիրների հետ, ինչպես խրոնիկական սթերսը, հոգնածությունը և լարվածությունը։ Տրամադրության հետ կապված խնդիրների պատճառով բարձրանում է ընկճախտի հավանականությունը։
Գիշերային հերթափոխով աշխատող մարդկանց շրջանում կարող են նաև աղեստամոքսային հիվանդություններ առաջանալ։